Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPT1P50897 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPT1P50897 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPT1P50897 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPT1P50897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPT1P50897 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms