Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFBP49765 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms