Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC11A1P49279 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC11A1P49279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms