Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NESP48681 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
NESP48681 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NESP48681 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NESP48681 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NESP48681 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NESP48681 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NESP48681 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NESP48681 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NESP48681 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NESP48681 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
NESP48681 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
NESP48681 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NESP48681 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NESP48681 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NESP48681 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NESP48681 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
NESP48681 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
NESP48681 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NESP48681 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
NESP48681 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NESP48681 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NESP48681 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NESP48681 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NESP48681 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NESP48681 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NESP48681 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NESP48681 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NESP48681 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NESP48681 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NESP48681 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NESP48681 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NESP48681 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
NESP48681 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
NESP48681 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
NESP48681 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
NESP48681 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms