Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN1S1P47710 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN1S1P47710 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms