Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GALR1P47211 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALR1P47211 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALR1P47211 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALR1P47211 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALR1P47211 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALR1P47211 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms