Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms