Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPRR1AP35321 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPRR1AP35321 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms