Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRS3P32247 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRS3P32247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRS3P32247 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRS3P32247 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRS3P32247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRS3P32247 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRS3P32247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRS3P32247 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms