Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCAP28676 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCAP28676 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCAP28676 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCAP28676 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCAP28676 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCAP28676 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCAP28676 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCAP28676 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCAP28676 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCAP28676 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCAP28676 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCAP28676 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms