Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms