Protein–RNA interactions for Protein: P24310

COX7A1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7A1P24310 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX7A1P24310 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COX7A1P24310 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms