Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms