Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.29■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 XRCC5-204ENST00000429133 576 ntTSL 413.82□□□□□ -0.27e-12■■■■■ 30.3
RPS3P23396 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 PET100-206ENST00000601829 317 ntTSL 211.22□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 30.3
RPS3P23396 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 310.83□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-209ENST00000531477 820 ntTSL 310.75□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 HNRNPA1P1-201ENST00000401954 944 ntBASIC10.35□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 UBE2A-209ENST00000629303 557 ntTSL 410.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-210ENST00000531718 575 ntTSL 410.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 XRCC5-203ENST00000417391 605 ntTSL 39.97□□□□□ -0.817e-12■■■■■ 30.3
RPS3P23396 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 59.53□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 PRKCSH-215ENST00000592435 358 ntTSL 59.37□□□□□ -0.919e-11■■■■■ 30.3
RPS3P23396 XRCC5-208ENST00000476360 610 ntTSL 28.82□□□□□ -17e-12■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-204ENST00000528361 1388 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.173e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-206ENST00000530783 675 ntTSL 56.91□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-207ENST00000530901 478 ntTSL 26.91□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CKS1B-205ENST00000473344 390 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-203ENST00000526822 853 ntTSL 25.46□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CKS1B-204ENST00000471245 1166 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 34.26□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 53.17□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.043e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 RPA3-207ENST00000483031 641 ntTSL 22.31□□□□□ -2.043e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 52.27□□□□□ -2.053e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 52□□□□□ -2.091e-6■■■■■ 30.3
RPS3P23396 XRCC5-205ENST00000451695 415 ntTSL 51.56□□□□□ -2.167e-12■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-205ENST00000529197 1149 ntTSL 1 (best)1.34□□□□□ -2.193e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM126B-208ENST00000531274 376 ntTSL 3-0.14□□□□□ -2.433e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM14C-202ENST00000466421 472 ntTSL 214.32□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 314.13□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.529e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.689e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 519.21■□□□□ 0.679e-8■■■■■ 30.3
RPS3P23396 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-10■■■■■ 30.3
RPS3P23396 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 30.3
RPS3P23396 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 30.3
RPS3P23396 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-16■■■■■ 30.3
RPS3P23396 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 320.04■□□□□ 0.89e-11■■■■■ 30.3
RPS3P23396 PSMA4-208ENST00000558639 733 ntTSL 37.13□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 30.3
RPS3P23396 NDUFB5-207ENST00000476587 635 ntTSL 22.42□□□□□ -2.027e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PRDX3-203ENST00000494433 2277 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CES1-205ENST00000563241 509 ntTSL 310.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 RAN-209ENST00000539498 1659 ntTSL 24.18□□□□□ -1.741e-15■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMEM59-208ENST00000452421 1074 ntTSL 517.66■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMEM59-206ENST00000420738 728 ntTSL 34.7□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMEM59-207ENST00000440019 618 ntTSL 24.7□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PGD-204ENST00000477958 508 ntTSL 316.02■□□□□ 0.166e-14■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.867e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.747e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.737e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TXN2-205ENST00000487725 736 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACOT2-202ENST00000538782 1578 ntTSL 212.98□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TXN2-202ENST00000403313 912 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.524e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PELP1-215ENST00000575534 601 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MRPL10-201ENST00000290208 2013 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TXN2-203ENST00000411915 570 ntTSL 59.67□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMX1-202ENST00000555574 943 ntTSL 216.24■□□□□ 0.191e-13■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMX1-203ENST00000556683 2117 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-13■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-13■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 COX6A1-203ENST00000550009 572 ntTSL 215.29■□□□□ 0.048e-25■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PSMA4-212ENST00000559365 786 ntTSL 526.01■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PSMA4-213ENST00000559437 756 ntTSL 58.02□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 54.06□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SCARB2-212ENST00000638663 1922 ntTSL 521.51■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C2orf69-202ENST00000491721 1034 ntTSL 221.66■■□□□ 1.068e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.048e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PTDSS1-201ENST00000337004 2366 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.878e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.858e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.848e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.828e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.818e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.88e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-203ENST00000474575 1064 ntTSL 219.86■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.768e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-207ENST00000532534 687 ntTSL 319.49■□□□□ 0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 319.18■□□□□ 0.668e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-6■■■■■ 30.2
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