Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF3P20783 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTF3P20783 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTF3P20783 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTF3P20783 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms