Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD58P19256 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD58P19256 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD58P19256 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD58P19256 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD58P19256 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD58P19256 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD58P19256 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD58P19256 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD58P19256 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD58P19256 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD58P19256 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD58P19256 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD58P19256 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms