Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XBP1P17861 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XBP1P17861 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XBP1P17861 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XBP1P17861 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XBP1P17861 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XBP1P17861 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XBP1P17861 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XBP1P17861 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XBP1P17861 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms