Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN2P17655 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms