Protein–RNA interactions for Protein: P15421

GYPE, Glycophorin-E, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPEP15421 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYPEP15421 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYPEP15421 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms