Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD8P13378 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms