Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT3P12035 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT3P12035 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT3P12035 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT3P12035 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT3P12035 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT3P12035 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms