Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms