Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI2P10070 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI2P10070 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GLI2P10070 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
GLI2P10070 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI2P10070 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI2P10070 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI2P10070 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI2P10070 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI2P10070 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI2P10070 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI2P10070 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI2P10070 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI2P10070 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI2P10070 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI2P10070 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI2P10070 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms