Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms