Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF728P0DKX0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms