Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFDP00746 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFDP00746 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFDP00746 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFDP00746 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFDP00746 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFDP00746 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFDP00746 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFDP00746 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFDP00746 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CFDP00746 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFDP00746 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms