Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLIT2O94813 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLIT2O94813 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms