Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms