Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms