Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45BO75293 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GADD45BO75293 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45BO75293 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms