Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD6O60522 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD6O60522 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD6O60522 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD6O60522 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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