Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL13O43927 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL13O43927 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms