Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms