Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SART1O43290 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SART1O43290 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SART1O43290 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SART1O43290 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SART1O43290 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SART1O43290 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SART1O43290 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SART1O43290 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SART1O43290 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms