Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEFVO15553 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEFVO15553 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEFVO15553 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEFVO15553 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEFVO15553 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEFVO15553 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms