Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLGNO14967 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLGNO14967 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLGNO14967 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLGNO14967 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLGNO14967 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLGNO14967 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms