Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3FO00303 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3FO00303 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3FO00303 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3FO00303 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3FO00303 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3FO00303 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms