Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3KT08 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3KT08 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
J3KT08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms