Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms