Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN34H7C241 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN34H7C241 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms