Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms