Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms