Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATL2C9JE40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms