Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms