Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms