Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF839A8K0R7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms