Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC10BA6NIK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms