Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms