Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLTPD2A6NH11 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLTPD2A6NH11 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms