Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC160A6NGH7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms